Кључна разлика: Пиримидин је хетероциклично ароматично органско једињење састављено од азота и угљеника. Пурин је такође хетероциклично ароматично органско једињење састављено од пиримидинског прстена спојеног са имидазолним прстеном. Примидинске базе се састоје од једне прстенасте структуре, док се Пурини састоје од спојеног двоструког прстена. Разликују се у многим аспектима као што су тачка топљења, точка кључања итд.

Пиримидин је хетероциклична или шесточлани хетероциклична једињења која поседују молекулску формулу Ц4Х4Н2. Хетероциклична једињења се односе на органска једињења која имају прстенасту структуру која садржи атоме као што су сумпор, кисеоник или азот. Пиримидини су у природи доступни у различитим облицима.

Реч пиримидин је сковао Пиннер 1884, који је комбиновао речи пиридин и амидин у облику пиримидина; на основу структурне сличности са тим једињењима. Он садржи два атома азота на првој и трећој позицији прстенастог пола.

Пурин се односи на групу хетероцикличних једињења која су састављена од структуре са два прстена састављена од атома угљеника и азота. Пурин је хетероциклично органско једињење које се састоји од пиримидинског прстена спојеног са имидазолним прстеном. Термин пурин је сковао Емил Фишер 1884. Као и пиримидин, он такође формира групу азотних база. Они су компоненте нуклеинских киселина.

Пиримидини и пурини су две различите групе органских база. Пиримидини имају тенденцију да буду мањи у поређењу са Пуринима, јер пиримидини садрже једну прстенасту структуру, а пурини имају двоструку прстенасту структуру.

Пиримидинске и пуринске базе су веома важне за живот јер су укључене у структуре ДНК и РНК. Оба спадају у царство органских једињења и суперкласичне ароматичне хетерополицикличне једињења. Пиримидини спадају у класу диазина, док пурини спадају у класу имадазопиримидина. Молекули пурина су комплексни и тежи од молекула пиримидина, па стога имају високе тачке топљења и кључања од пиримидина.

Поређење између пурина и пиримидина:

	Пиримидинес	Пуринес
Дефинитионс	Пиримидин је хетероциклично ароматично органско једињење састављено од азота и угљеника.	Пурин се односи на групу хетероцикличних једињења која су састављена од структуре са два прстена састављена од атома угљеника и азота
Екампле Нуцлеобасес	Тхимине, Урацил и Цитосине	Аденине и Гуанине
Структура	Садржи 1 прстен угљеника и азота и 2 атома азота	Састоји се од пиримидинског прстена спојеног са имидазолним прстеном. Садржи два прстена азота угљеника и четири атома азота.
Молецулар Формула	Ц4Х4Н2	Ц5Х4Н4
Тачка топљења и точка кључања	Компаративно ниже тачке топљења и кључања	Компаративно високе тачке топљења и кључања
Функционише као прекурсорски молекули	Није познато да функционише као прекурсорски молекул	Функционишу као прекурсорски молекули у синтези хемијских једињења као што је филилин