Кључна разлика: Аутоплаи испитује ново откривене преносиве медије и уређаје и покреће одговарајућу апликацију за репродукцију или приказивање садржаја. Ауторун открива ауторун.иф датотеку на медију и извршава инструкције у складу са датотеком.
У раду са компјутерима често наилазимо на појмове "аутоплаи" и "ауторун", а многи људи који нису толико технолошки паметни често збуњују ова два. Иако су ове речи сличне једна другој, оне се разликују по функцији. Такође се понашају различито у зависности од типа оперативног система који корисник тренутно користи.
Функција за аутоматско покретање олакшала је не-техничарима да инсталирају датотеку тако што су само ставили ЦД у ЦД лежиште; међутим, то такође смањује сигурност рачунара. На пример: ако је ЦД укључен у систем има вирус као и ауторун датотеку, систем ће наставити са покретањем датотеке и учитати вирус на систем. У случају аутоматске репродукције, од корисника ће тражити дозволу да учита једну или више датотека са ЦД-а. Аутоматска репродукција је била развијенија за музичке, видео и сликовне датотеке. Овај систем долази са системом руковаоца који се могу бавити играњем или приказивањем те врсте медија.