Кључна разлика: Католичка Библија садржи оригиналне четрдесет и шест књига Старог завета (које укључују седам књига апокрифа) и двадесет седам књига Новог завета. Протестантска Библија укључује само тридесет девет књига Старог завета и двадесет седам књига Новог завета.
Главна разлика између католичке и протестантске цркве је њихова вјера у погледу Библије. Католици сматрају да Библија има једнак ауторитет са Црквом и традицијом, док протестанти гледају на Библију као на врховни ауторитет вјере и праксе.
Треба напоменути да Библија није само једна књига; то је збирка књига од списа до историјских догађаја. То је библиотека прича о Исусовом животу, његовим апостолима и њиховим животима након што је Исус умро на крсту. Крајем 4. века, ови различити волумени и приче су уврштени у једну књигу, која је у суштини модерна библија, као што је знамо. Савремена Библија се састоји од два дела: Старог завета и Новог завета.
И католичка и протестантска Библија укључују Нови завет у истом формату. Разлика настаје у Старом завјету. Стари завјет, укључен у протестантску Библију, доживио је канонизацију доктрина или књига. Канонизација је процес одабира које књиге треба да остану и постану део Библије, а које треба искључити. Протестантска Библија садржи само оне књиге за које се сматрало да су Божје ријечи. Књиге и приче за које се сматрало да их је написао 'човек' су искључене. Овај процес канонизације трајао је много стољећа.
Стари завет у оригиналној Библији био је заснован на грчком преводу јеврејског писма, званом Септуагинта. Око 100. године, јеврејски рабини су ревидирали своје Писмо и успоставили службени канон јудаизма који је искључивао неке дијелове грчке Септуагинте.
Уклоњене књиге биле су Тобит, Јудита, 1 Макабејци, 2 Макабеја, Мудрост (Соломонова), Сирах и Барух. Делови постојећих књига су такође уклоњени, укључујући Псалам 151 (из Псалма), делове Књиге о Естери, Сузани (од Даниела као поглавље 13), и Бела и Змаја (од Даниела као поглавље 14).
Међутим, Римокатоличка црква није слиједила кораке протестаната и наставила је да базира свој Стари завјет на Септуагинти. Дакле, у основи католичка Библија још увијек садржи изворне четрдесет и шест књига Старог завјета (које укључују седам књига Апокрифа) и двадесет седам књига Новог завјета. Протестантска Библија, с друге стране, сада укључује тридесет девет књига Старог завета и двадесет седам књига Новог завета.