Кључна разлика: Коагулација значи згрушати се; он се у основи односи на хемијски процес у коме долази до дестабилизације честица које се не могу поделити. Ове честице формирају грудве уз помоћ коагуланта. С друге стране, флокулација значи формирање флокула. Може се описати као физички или механички процес у којем су коагулисане груде или флокци спојени заједно да формирају масе као облак, а затим преципитат.

Вода може да садржи колоидне чврсте материје као што су неотапљива органска материја, глинене честице, бактерије, планктон, мале честице распаднутог биљног материјала, итд.
Коагулација се постиже неутрализацијом честица и тиме се сила одбијања између честица знатно смањује. После примене процеса флокулације, коагулисане честице формирају велику агломерацију, која је такође позната као флок.

У флокулацији, ове агломерације дестабилизованих честица имају облик великих честица. Ово се такође може постићи додавањем органских полимера који су растворљиви у води. Због ових полимера, величина флока се повећава и онда се честице слегну. Врло је важно лагано мијешати флокулирајуће средство при малој брзини тако да се мале гомиле лако могу агломерирати у велике честице и коначно се смирити.
За третман воде, коагулација је обично праћена флокулацијом.
Дакле, у смислу третмана воде, оба се могу лако разликовати. За време коагулације, додаје се коагулант да се скупљају честице заједно. С друге стране, током флокулације, раствор се лагано меша, тако да се мале грудице формирају током коагулације, да се споје и формирају веће грудице. Ове велике грудице се лако слегну и могу се раздвојити.