Кључна разлика: Схиа је један од два главна секта ислама, а други је сунит. Исмаили је подјела унутар шиитске секте. Подела је због избора имама.
Пре него што схватите како се шијити раздвајају на ове три гране, важно је разумети како су настале разлике између сунита и шиита. Под Мухаммедом су сви муслимани сматрани једним. Мухамед се сматра коначним Божјим пророком. Разлике су уследиле након Мухаммедове смрти. Мухамед је умро без званичног проглашења наследника који би водио муслиманску заједницу. Постојала су два главна кандидата: Абу Бакр (Мухамедов свекар) и Али (Мухамедов рођак и зет). Сунити су изабрали Абу Бакра, пријатеља и поузданика Мухамеда као калифа који је водио и саветовао. Међутим, шијити су веровали да калифат треба да остане у породици Мухаммеда и зато је више волио Алија као вођу. Али је постао четврти калифат под сунитском владавином. Поред ових, постоје и друге мале разлике у погледу тога како се моле и шта они верују. Због ових разлика између шиита и сунита, стално се сукобљавају два секта ислама.
Схиа се такође суочио са неким унутрашњим неслагањима у вези са имама и који би требало да воде као имама. Под шиинским исламом, имам се сматра вођом на кога се гледа као на водство за све аспекте живота. Према схиа доктрини, имама је божанска институција која је наследила институцију пророштва. Они вјерују да су имами бирани и бирани од стране божанских бића, они имају потпуно знање и могу исправно протумачити Ку'ран. Сада, разлика између Схиа се разликује због избора Имама. Исмаили је огранак шиитског ислама који је назван по Исмаилу ибн Ја'фару, за кога вјерују да је с правом именован имама или духовни насљедник. Ово се разликује од дванаесторице која верује Муса ал-Казим, млађег брата Исмаила, као истинског имама.
Исмаилизам је у једном тренутку био највећа грана Шизима која је била у политичкој власти током десетог и дванаестог века. Пошто је Исмализам грана и дио Шија, обоје дијеле многа увјерења, укључујући и да постоји само један прави Бог и да би имами требали бити потомци Мухамеда кроз његову кћер, Фатиму. И Шиаси и Исмаили верују да је породица Мухаммада (Ахл ал-Баит) божански изабрана, непогрешива и вођена од Бога да води исламску заједницу.
Низари Исмаили је пут (тариках) шиитског ислама, наглашавајући социјалну правду, плурализам и људски разум у оквиру мистичне традиције ислама. Сматра се другом највећом граном ислама и чини већину Исмаилија. Мустаали Исмаили је секта Исмаили Схиа ислама. Главна разлика између Низари Исмаила и Мустаали Исмаилија је онај који је требао водити као имама. Низарис је прихватио Имама Низара (првог) као деветнаестог имама, док Мустаалис сматра да је млађи брат Низар Мустали. На челу с муслиманима Низари је Ага Кхан ИВ, који је познат као Имам Схах Карим.
Према Википедији, “Муста'лиииах се такођер називају Таииаби или иаиииби, након посљедњег Имама којег препознају, иаиииб Аби л-Касим. Историјски, постојала је разлика између бетвеенаииибиииах и изиафизиииах, који је препознао Фатимидске владаре Египта (између 1130-1169) као легитимне Имаме, а не Таиииб Аби л-Каим. Хафизин поглед изгубио је сву подршку након пада Фатимидске династије: данашњи Муста'лиииа су сви иаииибиииах. Највећа група Мустаали је Бохра, а највећа Бохра група је Давооди Бохра, углавном пронађена у Индији. Име Бохра је реинтерпретација гуџаратске ријечи вахаурау ("трговати"). Људи из Бохре чине две главне групе: већином трговачку класу, већину и суннску мањину, углавном сељачке фармере.
Схиа и Исмаили су прилично слични у својим вјеровањима и културама, јер су исмаилити дио шиитске секте. Све секте дијеле исто увјерење о Аллаху и Мухаммеду. Аллах се вјерује једном и истинитом Богу, с тим да је Мухамед посљедњи Божији пророк.