Кључна разлика: Пиноцитоза је апсорпција течности, док је фагоцитоза апсорпција чврстих предмета који су у основи храна за ћелију.
И пиноцитоза и фагоцитоза су типови ендоцитозе. Ендоцитоза је процес којим ћелије апсорбују молекуле тако што их захватају. Ови молекули често укључују протеине и друге супстанце које су важне за постојање ћелије. Процес ендоцитозе користе све ћелије јер су молекули велики поларни молекули који не могу да прођу кроз хидрофобну плазму или ћелијску мембрану.
Пиноцитоза је апсорпција течности, док је фагоцитоза апсорпција чврстих предмета који су у суштини храна за ћелију. Скоро све ћелије изводе пиноцитозу, али се фагоцитоза обавља само од стране специјализованих ћелија које штите ткива, захваћајући бактерије, остатке ћелија и друге абнормалне материјале.
Пиноцитоза је у суштини процес апсорбовања течности заједно са садржајем у ћелију. Ћелија то ради формирањем уских канала кроз своју мембрану. Ови канали окружују течност и све њене садржаје, а затим се стисну у везикуле, па се течност успешно апсорбује у ћелију. Молекули се затим стапају са лизосомима да би се хидролизовали или разградили. Процес пиноцитосис захтијева пуно енергије у облику аденозин трифосфата. То је хемијско једињење које се обично користи као енергија у већини ћелија.
Фагоцитоза је процес апсорбовања и гутања честица од стране ћелије и многих протеста, као што је амеба за стицање хранљивих материја. Процес апсорпције је сличан пиноцитози, осим што је умјесто текућине апсорбирана супстанца есенцијална храњива, која су окружена каналом, а затим стиснута у везикуле. Потом се хранљиве материје спајају са лизосомима и разлажу се ензимима. Сваки отпадни материјал се затим избацује из ћелије.
Фагоцитоза је синоним за исхрану за једноћелијске организме, међутим, код вишестаничних животиња, овај процес је прилагођен да елиминише отпад и остатке, за разлику од узимања хранљивих материја и горива за ћелијске процесе. Ово је посебно случај са ћелијама имуног система које користе фагоцитозу за уклањање патогена и других ћелијских остатака, укључујући, али не ограничавајући се на бактерије, ћелије мртвог ткива и мале честице минерала.
Супстанца која се апсорбује фагоцитозом може бити велика као и ћелија, што захтева да ћелија ствара везикуле довољно велике да окружују хранљиве материје. Међутим, код пиноцитозе, везикуле су много мање, јер само треба да окружују течности, које немају специфичан облик. Технички, пиноцитоза функционише као фагоцитоза, једина разлика је што је фагоцитоза специфична у супстанцама које транспортује. То је због чињенице да фагоцитоза захвата целе честице, које се касније разграђују од стране ензима и апсорбују у ћелије, док пиноцитоза углавном апсорбује већ растворену или разбијену храну.